▶ 자연과학/▷ 화학정보학 썸네일형 리스트형 【화학정보학】 유기화학 관련 파이썬 함수 모음 유기화학 관련 파이썬 함수 모음 (화학정보학, chemoinformatics; structural bioinformatics) 추천글 : 【유기화학】 유기화학 목차, 【Python】 파이썬 유용 함수 모음 1. 명명법 [본문]2. 드로잉 [본문]3. 아미노산 [본문]4. 분광학 [본문]a. 생물정보학 1. 명명법 [목차]⑴ SMILES(simplified molecular-input line entry system) : 짧은 ASCII 문자열 표현① 이중결합은 '='로, 삼중결합은 '#'로 나타냄② 고리형 화합물의 경우, 1, 2, ···과 같은 숫자를 부여하여, 선형 분자의 끝과 끝이 연결돼 고리를 이루는 것을 나타냄○ 예 : CN1C=NC2=C1C(=O)N(C(=O)N2C)C ③ C는 일반 탄소를 .. 【화학정보학】 프로테오믹스 분석 파이프라인 프로테오믹스 분석 파이프라인 추천글 : 【생물정보학】 생물정보학 분석 목차 1. 단백질-단백질 상호작용 [본문]2. 단백질 변이 기능 예측 [본문] 1. 단백질-단백질 상호작용(protein-protein interaction; PPI) [목차]⑴ 주요 사항① 결합 친화도(결합세기, BA, binding affinity)는 일반적으로 해리 상수(Kd) 또는 억제 상수(Ki)에 의해 정량화됨 ② PPI의 일반 고려 사항 ○ 일반적인 특성 (예 : 원자 유형)○ 물리화학적 특성 (예 : 제외된 부피, 부분 전하, 무거운 원자 이웃, 이종 원자 이웃, 혼성화)○ 약리학적 특성 (예 : 소수성, 방향성, 산/염기, 고리 형태)③ 데이터셋○ PDBbind database of version 2016 ○ 부분집합 .. 【화학정보학】 물질 라이브러리 물질 라이브러리(chemoinformatics) 추천글 : 【생물정보학】 생물정보학 분석 목차 일부 포스팅은 비공개로 설정해 두었습니다. 화합물 라이브러리 화학약품 라이브러리 화학작용제 유효소독제 약물 라이브러리 약물 클래스 라이브러리 저분자 약물 데이터베이스 종류 암종에 따른 약물 종류 New Cancer Drugs Approved by the FDA in 20 years 생체고분자 라이브러리 마커 물질 라이브러리 생물학 실험에 사용되는 형광물질 라이브러리 광감각제 라이브러리 입력: 2023.12.11 14:20 【화학정보학】 생물학 실험에 사용되는 형광물질 라이브러리 생물학 실험에 사용되는 형광물질 라이브러리(dye library) 추천글 : 【생물학】 37강. 생물학 실험, 【화학정보학】 물질 라이브러리 ○ 1,8-ANS(1-anilinonaphthalene-8-sulfonic acid) ○ 6,8-Difluoro-7-hydroxy-4-methylcoumarin ○ 7-Amino-4-methylcoumarin ○ 7-Hydroxy-4-methylcoumarin ○ Acridine Orange ○ Alexa Fluor : 항체 등에 사용 시 labeling reaction을 거쳐야 함 ○ Alexa Fluor 350 ○ Alexa Fluor 405 ○ Alexa Fluor 430 ○ Alexa Fluor 488 ○ Alexa Fluor 514 ○ Alexa Fluor.. 【화학정보학】 저분자 약물 데이터베이스 종류 저분자 약물 데이터베이스 종류 추천글 : 【화학정보학】 물질 라이브러리1. protein representation [본문]2. molecular representation [본문]3. 저분자 데이터베이스 [본문]4. 저분자 시뮬레이션 [본문]5. 약물 유전체 데이터베이스 [본문]a. 약물 라이브러리b. 약물 클래스 라이브러리 1. protein representation [목차]⑴ AAC (Amino Acid Composition) - 20D⑵ Dipeptide Composition Descriptor - 400D⑶ Tripeptide Composition Descriptor - 8000D⑷ Composition, Transition and Distribution (CTD) - 147D⑸ ProtVe.. 【화학정보학】 New Cancer Drugs Approved by the FDA in 20 years New Cancer Drugs Approved by the FDA in 20 yeas 추천글 : 【화학정보학】 물질 라이브러리 출처 : FDA, 2021년 5월 기준 a. 약물 라이브러리 b. 약물 클래스 라이브러리 1. small molecule : name; generic name; target; class; indication; FDA approval time 순으로 정리 ○ Tabrecta; Capmetinib (2); MET; Signaling/Kinase; NSCLC; 2020 ○ Ayvakit; Avapritinib (2); PDGFRa; Signaling/Kinase; GIST; 2020 ○ Retevmo; Selpercatinib (2); RET; Signaling/Kinase; NSCL.. 【화학정보학】 마커 물질 라이브러리 마커 물질 라이브러리 추천글 : 【화학정보학】 물질 라이브러리 1. 개요 [본문]2. 분자경로 [본문]3. 세포작용 [본문]4. 생리작용 [본문] 1. 개요 [목차]⑴ 기타 부족한 정보는 수십억 개의 논문을 큐레이션 한 https://typeset.io/, https://www.scinapse.io/를 참고할 수 있음 2. 분자경로 [목차]⑴ 아폽토시스 마커 ○ annexin-V staining ○ TUNEL assay(terminal transferase dUTP nick-end labeling) ○ γ-H2AX assay ○ Calcein-AM assay○ PI(propium assay)○ Ki-67 assay○ DAPI○ CD8-PD1○ caspase 3/7○ PARP cleavage○ 8-OHd.. 【화학정보학】 암종에 따른 약물 종류 암종에 따른 약물 종류(examples of drugs according to cancer types) 추천글 : 【화학정보학】 물질 라이브러리 출처 : NCI 2020 a. 약물 라이브러리 b. 약물 클래스 라이브러리 1. Lymphoma (30) ○ Ibritumomab tiuxetan (ZevalinⓇ) ○ Denileukin diftitox (OntakⓇ) ○ Brentuximab vedotin (AdcetrisⓇ) ○ Rituximab (RituxanⓇ) ○ Vorinostat (ZolinzaⓇ) ○ Romidepsin (IstodaxⓇ) ○ Bexarotene (TargretinⓇ) ○ Bortezomib (VelcadeⓇ) ○ Pralatrexate (FolotynⓇ) ○ Ibrutinib .. 이전 1 2 다음
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